日常法律问答解答参考：
恶意不签劳动合同申请工伤认定的，可以通过以下凭证证明事实劳动关系：考勤记录；工资支付凭证或记录；劳动者填写的用人单位招用记录；用人单位向劳动者发放的能够证明身份的证件；缴纳各项社会保险费的记录；其他。
相关法律：
《关于确立劳动关系有关事项的通知》 第二条
用人单位未与劳动者签订劳动合同，认定双方存在劳动关系时可参照下列凭证：
（一）工资支付凭证或记录（职工工资发放花名册）、缴纳各项社会保险费的记录；
（二）用人单位向劳动者发放的”工作证”、”服务证”等能够证明身份的证件；
（三）劳动者填写的用人单位招工招聘”登记表”、”报名表”等招用记录；
（四）考勤记录；
（五）其他劳动者的证言等。
其中，（一）、（三）、（四）项的有关凭证由用人单位负举证责任。