日常法律问答解答参考：
申请软件著作权证书的程序：当事人向中国版权保护中心提出软件著作权申请并提交相应的材料文件。中国版权保护中心接到申请后会审理申请是否合法、材料是否完备。经审定符合规定的，中国版权保护中心会予以登记，发给相应的登记证书，并予以公告。
相关法律：
《计算机软件著作权登记办法》 第九条
申请软件著作权登记的，应当向中国版权保护中心提交以下材料：
按要求填写的软件著作权登记申请表；
软件的鉴别材料；
相关的证明文件。
《计算机软件著作权登记办法》 第二十条
中国版权保护中心应当自受理日起60日内审查完成所受理的申请，申请符合和本办法规定的，予以登记，发给相应的登记证书，并予以公告。