日常法律问答解答参考：
农村自建房办房产证去房地产行政主管部门。我国法律规定，县级以上人民政府房地产行政主管部门负责房地产权属登记管理工作，市、县人民政府房产管理部门、土地管理部门具体办理房地产权登记手续，核发房地产权属证书。
相关法律：
《城市房地产管理法》 第四条
国家根据社会、经济发展水平，扶持发展居民住宅建设，逐步改善居民的居住条件。
第七条
国务院建设行政主管部门、土地管理部门依照国务院规定的职权划分，各司其职，密切配合，管理全国房地产工作。县级以上地方人民政府房产管理、土地管理部门的机构设置及其职权由省、自治区、直辖市人民政府确定。