日常法律问答解答参考：
政府部门作为被告的行政诉讼的管辖的确定方式：行政案件由最初作出行政行为的行政机关所在地人民法院管辖；经复议的案件，也可以由复议机关所在地人民法院管辖；两个以上人民法院都有管辖权的案件，原告可以选择其中一个人民法院提起诉讼。
相关法律：
《中华人民共和国行政诉讼法》 第十八条
行政案件由最初作出行政行为的行政机关所在地人民法院管辖。经复议的案件，也可以由复议机关所在地人民法院管辖。
经最高人民法院批准，高级人民法院可以根据审判工作的实际情况，确定若干人民法院跨行政区域管辖行政案件。
《中华人民共和国行政诉讼法》 第十九条
对限制人身自由的行政强制措施不服提起的诉讼，由被告所在地或者原告所在地人民法院管辖。