日常法律问答解答参考：
法院判决的赔偿款不会扣除医药费。根据法律规定，当事人侵权造成他人人身损害的，应当赔偿医药费、误工费、护理费等费用。医药费即使先由医疗保险垫付，之后医疗保险机构也可以向侵权第三人追偿。
相关法律：
《民法典》第一千一百七十九条
侵害他人造成人身损害的，应当赔偿医疗费、护理费、交通费、营养费、住院伙食补助费等为治疗和康复支出的合理费用，以及因误工减少的收入。造成残疾的，还应当赔偿辅助器具费和残疾赔偿金；造成死亡的，还应当赔偿丧葬费和死亡赔偿金。
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知法-守法-用法
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