日常法律问答解答参考：
分居五六年一方不愿意离婚的，可以向人民法院起诉离婚，也可以向有关组织申请进行调解。法院会对双方先进行调解，调解不成的，夫妻双方分居五六年的，法院一般都会准予离婚。
相关法律：
《中华人民共和国民法典》 第一千零七十九条
夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。
人民法院审理离婚案件，应当进行调解；
如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。
有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：
重婚或者与他人同居；
实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；
有赌博、吸毒等恶习屡教不改；
因感情不和分居满二年；
其他导致夫妻感情破裂的情形。
一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
经人民法院判决不准离婚后，双方又分居满一年，一方再次提起离婚诉讼的，应当准予离婚。